细胞摇瓶在液体菌种培养中具有普遍的应用，灵芝就是采用的这种培养方式。灵芝液体发酵培养菌丝生长快，一般在45天就可完成一次发酵。液体发酵时由于所用培养原料都为速效养分又不断搅拌，所以一旦感染杂菌就会马上大量繁殖从而造成发酵失败。所以液体深层培养对培养基有以下要求：
125ml三角细胞摇瓶
1. 液体发酵培养需要速效的配伍培养基，适当的pH、温度和通风条件。
2. 液体深层发酵培养需要碳源养分、氮源养分和微量元素养分。
3. 灵芝深层发酵所需要的碳源养分有葡萄糖、蔗糖、麦芽糖、淀粉等，其中尽量好利用葡萄糖。
4. 葡萄糖、麦芽糖、蔗糖是小分子糖，培养基中用量过高时会使渗透压提高从而会使菌丝内的水分外渗造成生理缺水而生长不出或不能生长。
500ml三角细胞摇瓶
5. 淀粉是一种大分子的物质在水溶液不易形成高渗现象，所以用玉米粉或淀粉做碳源养分时，淀粉用量可提高可达到5-6%左右。
6. 氮源是构成细胞的主要物质，液体发酵通常用的氮源物资有玉米浆、玉米粉、鱼粉、蚕蛹粉、酵粉等。
7. 灵芝深层培养需要的金属元素主要是P、K、Mg、Ca、Zn、S等元素的无机盐，其中对P、K、Mg的需要量比较多。
8. 除P元素外灵芝对这些金属元素的要求只要培养基总量的百万分之几即可。由于需要量甚微一般天然培养基中所含有的微量元素已足够其生长之用。
2L细胞转瓶
利用细胞摇瓶培养灵芝时，一定要注意以上几点。此外还需要合适的酸碱度、温度条件、通气等条件，控制好接种量，才能保证菌丝的正常发酵。
